Mattojen pesu järvessä tai meressä likaa vesistöjä ja edesauttaa rehevöitymistä ja siten esimerkiksi leväongelmia. Jokien kaltaiset pienet vesistöt voivat vahingoittua vähäisestäkin jätevesikuormituksesta. Esimerkiksi Helsingissä vanhoja rantojen mattolaitureita ei enää kunnosteta, ja Turussa ne on poistettu kokonaan. Uusia pesupaikkoja rakennetaan vain kuivalle maalle.
Pesupaikan vedet voidaan rinnastaa harmaisiin talousjätevesiin eli erilaisiin asumisesta ja kotitalouksista syntyviin pesuvesiin. Tällaiset vedet tulisi käsitellä ennen vesistöön joutumista.
Mattojen pesuvesissä on runsaasti ravinteita, ja etenkin likaisista eteismatoista irtoaa bakteereja. Matonpesupaikkojen siirtämisellä kuivalle maalle saadaan kuitenkin selviä ympäristöhyötyjä.
Matonpesua veden äärellä ei ole kielletty lailla tai kaupungin järjestyssäännöillä, mutta yleisen mielipiteen mukaan sen tulisi vähentyä.